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奧密克戎出現更“人類化”的基因片段,可能導致免疫逃逸

關鍵詞:COVID-19
時間:2021-12-07 12:53:21


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  由于Omicron突變株(B.1.1.529)發生了更多功能性突變,因此很可能對人類造成更大威脅。

  其中Omicron極強的傳染性和潛在的免疫逃逸令人憂慮。

  英國COVID基因組聯盟(GOG-UK)公布的新研究顯示,Omicron突變株S蛋白的32個突變部位中,至少有3個與其傳染性增強有關。

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(Covid Genomics UK Consortium (COG-UK) 昨天發布了 Omicron 突變株的 32 個突變(左)的新圖像,并與Delta突變株(右)對比。他們展示了該變體的三個突變——H655Y、N679K 和 P681H,位于圖像的右下方——這可以幫助病毒更容易地進入到人體。圖源:每日郵報)

  Omicron也確實展現了更高的傳染性。

  Trevor Bedford剛剛發表的Twitter指出,根據Gauteng地區Delta和Omicron的流行病學數據和他的模型對比,估算出Omicron突變株在南非的實時傳播系數Rt大約為3-3.5;而Delta突變株在南非和美國的初始Rt是1.5。


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(Omicro突變株飆升的傳染率)

  2021年12月2日,OSF預印網站發布了位于美國劍橋的生物醫學數據分析公司Nference Inc的研究論文,顯示Omicron突變株有一個插入突變,其遺傳物質很可能來源于導致普通感冒的HCoV-229E冠狀病毒。

  但這段特殊的基因序列也存在于能導致艾滋病的人類免疫缺陷病毒(HIV)和人類基因組中,COVID-19;Omicron突變株;免疫逃逸

  研究者認為,這可能意味著Omicron突變株更容易傳播,但相對來說癥狀更為輕微。

  該研究迅速受到各主要媒體的關注和解讀。

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  研究者首先比較了Omicron突變株和既往突變株的基因組差異,發現Omicron的S蛋白有26個氨基酸突變,其中23個替換、2個缺失和1個插入。

  替換和缺失的突變在之前的突變株中均出現過,但是插入突變(ins214EPE)卻是首次在新冠病毒(SARS-CoV-2)中出現。

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(突變對比)

  進一步單細胞RNA測序顯示,該插入序列表達于普通感冒冠狀病毒(HCoV-229E)。

  而早期研究顯示,宿主的肺臟和腸道可以同時存在新冠病毒和普通感冒冠狀病毒。研究者推測,可能由此為兩種病毒重組創造了條件。

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(研究者推測的兩種病毒重組)

  盡管這段插入基因序列引發了科學家和媒體的廣泛興趣,并看起來似乎確實“Omicron突變株更容易傳播,但癥狀相對輕微”;但我們還是需要強調:對于突變株重要的關鍵特征,傳播能力、毒力免疫逃逸能力,目前仍沒有一錘定音的數據。

  另外也需要看到,這篇預印論文尚未經專業的同行評議,且公布的論文缺乏Omicron這段“可能來自于普通感冒冠狀病毒”基因序列發生過程及作用的確鑿證據。

  根據衛生組織公布的消息,Omicron已經在全球38個和地區蔓延。

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  面對這個尚待研究的突變株,我們有理由擔心會有更多恐怖的突變株會出現。

  我們更不能心懷僥幸,期待Omicron可能的“傳染性強、卻毒力弱”,從而取代Delta突變株。

  人類不能把自己的命運交給新冠病毒。

  更快速度普及疫苗接種,才是真正能夠把人類從可怕的新冠病毒大瘟疫中解救出來的方法。


(本文來源:Hanson臨床科研公眾號)

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